Lúc mới thành lập kênh VTV3, do thiếu chương trình để phát, nhà báo Lại Văn Sâm được giao nhiệm vụ phải dẫn dắt SV 96 với thời lượng 3 tiếng đồng hồ. Để đảm bảo độ hấp dẫn, thú vị với thời gian dài như vậy, Lại Văn Sâm cho biết đây là một nhiệm vụ bất khả thi. "...nếu cố gắng lắm cũng chỉ có thể kéo dài được 2 tiếng. Cuối cùng các chương trình chỉ kéo dài được khoảng 100 phút", nhà báo Lại Văn Sâm chia sẻ. "Tôi còn nhớ riêng trận chung kết SV 96 chúng tôi làm từ 8 giờ tối đến 12 giờ đêm, kéo dài 4 tiếng đồng hồ. Và đó cũng là chương trình truyền hình trực tiếp đầu tiên của VTV".

Ngoài khó khăn về thời lượng, SV 96 còn gặp vô số những khó khăn khác như chi phí đầu tư hay tìm địa điểm thực hiện chương trình. Một chương trình hoành tráng như SV 96 cũng chỉ có đúng 10 triệu đồng chi phí sản xuất. Trong đó tiền thuê địa điểm, âm thanh, ánh sáng hết 3 triệu, giải thưởng cho các đội hết 3 triệu.

"Mỗi một cuộc SV chúng tôi tổ chức chỉ phát khoảng vài nghìn vé nhưng thực tế lượng người đến xem lúc nào cũng 5 - 6 nghìn người, thậm chí có nơi lên đến hàng chục nghìn. Tôi còn nhớ, trận đấu SV đầu tiên được tổ chức tại nhà văn hóa Từ Liêm, toàn bộ ghế bị dẫm đạp gãy hết và lần đầu tiên Đài THVN phải đền bù hết 47 triệu đồng. Đó là một số tiền vô cùng lớn lúc bấy giờ".[6]